Intentando dominar el mundo, el genio malvado Dr. Evil Dr. Maligno, Dr. Malito o Dr. Malo en versiones dobladas regresa al año 1969 para robar a Austin Powers su secreto de poder sexual: El Mojo. Ahora Austin debe viajar en el tiempo para recuperarlo y detener a su enemigo antes de que éste destruya al mundo. Junto a la atractiva agente de la CIA Marife , Austin deberá enfrentar el imperio del crimen organizado y al malévolo Dr. Evil.